DIPUV-MiniとTidas分光計を用いたDNA/RNA定量法

概要

ミニUV/VISディッピングプローブ

溶液中のDNA濃度(31µg/mLおよび688µg/mL)は、DIPUV-Miniの分光光度計とUV/VIS光源を用いて測定されました。2mmの光路長のため、DIPUV-Miniの使用ではこの濃度範囲内で事前希釈が不要であり、誤差の可能性が排除されました。

実験手順

DipTip Miniと1セント硬貨の比較

DNAの標準溶液(Sigma D1626)は18.2MΩ/cmの超純水を溶媒として重量法で調製しました。溶液濃度は0.0µg/mLから687.6µg/mLの範囲で調製されました。

測定はDIPUV-Miniを用いて3回ずつ行いました。DIPUV-MiniはUV/VISの光源(WPI #D4H)に接続されていました。

データは装置の全範囲(190nm〜720nm)で1nm刻みで収集されました。装置は参照測定で総強度の80%を得るように設定されました。すべての測定は18.2MΩ/cmの超純水を参照溶液として使用しました。

結果

実験結果は表1に示されています:

DNA [µg/mL] 吸光度 @260nm [AU]
0.00 -0.0017
30.83 0.1116
56.59 0.1945
85.49 0.3012
115.66 0.3821
143.94 0.4551
281.63 0.8399
428.91 1.2409
561.15 1.5639
687.61 1.7340

表1:DNA濃度とそれに対応する吸光度値

吸光度は濃度に関してビール・ランバートの法則に従うため、

A= εlc
期待される吸光度値はDNA溶液の濃度から計算されました。二本鎖DNA(dsDNA)のεの文献値は0.020µg/mL*cmとされています。

実験データは図1に示されており、計算された吸光度測定値は実線で示されています。吸光度測定は260nmの波長で表されています。高い吸光度値で理論値からのずれが生じるのは、分光光度計内の迷光干渉によるものです。

 

測定値と理論値の比較

 図1:測定値と理論的吸光度の比較

典型的なDNA測定値

図2:典型的なDNA測定値(281.6µg/mL)

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