Quantification de l'ADN/ARN à l'aide du DIPUV-Mini et d'un spectromètre Tidas

Résumé

Sonde d'immersion UV/VIS Mini

Les concentrations d'ADN en solution (31µg/mL et 688µg/mL) ont été mesurées avec un spectromètre et une source lumineuse UV/VIS dans un DIPUV-Mini. En raison de la longueur de trajet de 2 mm, l'utilisation d'un DIPUV-Mini ne nécessite pas de dilution préalable dans cette plage de concentration, éliminant ainsi une source potentielle d'erreur.

Procédure expérimentale

DipTip Mini comparé à une pièce de un centime

Des solutions standards d'ADN (Sigma D1626) ont été préparées gravimétriquement en utilisant de l'eau ultrapure 18,2 MΩ/cm comme solvant. Les solutions ont été préparées entre 0,0µg/mL et 687,6µg/mL.

Les mesures ont été prises en triplicata à l'aide d'un DIPUV-Mini. Le DIPUV-Mini était connecté à une source lumineuse UV/VIS (WPI #D4H).

Les données ont été collectées par incréments de 1 nm sur toute la plage de l'instrument (190 nm-720 nm). L'instrument a été configuré de manière à ce que les mesures de référence donnent une intensité totale de 80 %. Toutes les mesures ont utilisé de l'eau ultrapure 18,2 MΩ/cm comme solution de référence.

Résultats

Les résultats expérimentaux sont présentés dans le Tableau 1 :

ADN [µg/mL] Absorbance @260nm  [AU]
0.00 -0.0017
30.83 0.1116
56.59 0.1945
85.49 0.3012
115.66 0.3821
143.94 0.4551
281.63 0.8399
428.91 1.2409
561.15 1.5639
687.61 1.7340

Tableau 1 : Concentrations d'ADN et valeurs d'absorbance résultantes

Puisque l'absorbance en fonction de la concentration suit la loi de Beer-Lambert,

A= εlc
Les valeurs d'absorbance attendues ont été calculées à partir des concentrations de la solution d'ADN. Les valeurs de littérature de ε pour l'ADN double brin (dsDNA) sont listées comme 0,020µg/mL*cm.

Les données expérimentales sont présentées dans la Figure 1 avec les mesures d'absorbance calculées indiquées par une ligne pleine. Les mesures d'absorbance sont exprimées à une longueur d'onde de 260 nm. L'écart par rapport à la valeur théorique à des valeurs d'absorbance plus élevées est dû à une interférence de lumière parasite dans le spectromètre.

 

Valeur mesurée vs. théorique

 Figure 1 : Absorbance mesurée versus théorique

Mesure typique de l'ADN

Figure 2 : Mesure typique de l'ADN (281.6µg/mL)

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